I laureati magistrali possono completare la loro specializzazione con un master di secondo livello erogato da università italiane purchè vengano rilasciati 60 crediti formativi. Sono infatti definiti master di II livello i percorsi postlaurea rivolti a ragazzi, ragazze e giovani professionisti con laurea magistrale.
I laureati con master in pubblica amministrazione aspirano a carriere da manager presso enti pubblici, fondazioni, associazioni che si occupano di politiche pubbliche, sanità, gestione relazioni pubbliche, internazionali, dirigenti e funzionari della pa. Gli studenti di questi programmi di specializzazione sono ragazzi e ragazze interessati alla cosa pubblica e alle politiche sociali.
Il Master è finalizzato a fornire competenze contabili, finanziarie e fiscali ed eroga 90 CF per gli iscritti al CNDCEC. Le quote di partecipazione variano in base alla tipologia di percorso scelto. Sono inoltre presenti delle agevolazioni per coloro che decidono di intraprendere questo percorso.